开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)
一、选题
1、选题思路
传统的药物研究方法使得研发环境处于一种快速但不够高效的困境之中,传统的先导化合物的发现与优化过程,有着时间、金钱投入大,但效果甚微的矛盾。随着医药行业的不断发展以及老龄化问题的出现,全球人类对于药物的需求从“有”到追求“多与精”变化着,那如何能够快速、高效的寻找并优化先导化合物,使其成为具有临床意义的药物有效成分是我的主要着眼点。经了解,计算机辅助药物设计逐渐登上了药物研究的舞台,运用强大体量的数据库和计算机辅助计算完成分子对接与小分子的优化,精准且高效。计算机辅助药物的精准、高效、成本低等优点使其未来作为前期研究方法的主流选择成为必然趋势,我也很荣幸能在本科阶段接触到相关软件和研究,因此决定以“分子对接和小分子优化”为课题,以找到与已知蛋白相匹配的小分子以及小分子优化为目的,进行我的本科毕业设计。
2、选题意义
分子对接能够通过研究生物大分子和配体的结构和相互作用,预测亲和性,同时也能整体地考虑到蛋白生物大分子和配体小分子结合后的效果如何,避免了在实验过程才发现配合结合欠佳,或临床研究时才发现疗效差、临床意义小等问题。小分子优化则又使得在发现较优且具有一定临床疗效的先导化合物成为更加具有临床意义的、可作为临床用药批量生产的有效成分。
那么选择“分子对接与小分子优化”作为毕业设计的课题,一方面能够丰富自身在计算机辅助药物设计以及分子对接方面的知识储备和专业技能,同时也能够深切体会到此步骤对于未来医药行业发展的重要性。在药学发展里,分子对接与小分子优化是里程碑式的进步,我也希望能够在此次毕业设计中在学习到基本知识的基础上,能够对该课题或该领域有更加深刻的理解和认识,或者说能够为未来在此行业深究打下坚实基础。对于我个人来说,该选题能够给我带来计算机辅助药物设计的完整框架和入门体验;对于该学科来说,也是一次很好的科普和宣传。
二、学术成果回顾
1.分子对接的原理
关于“分子对接”说法的出现追溯到十九世纪,Fisher提出的受体学说,药物小分子与生物体内的蛋白大分子通过一种类似于锁和钥匙的方式进行识别与结合。
