基于ENTREZ和SRS的生物信息数据检索对比研究文献综述

 2023-01-03 16:07:08

一、课题研究的背景和意义生物信息学(bioinformatics)是近些年来在生命科学的研究领域发展起来的一门由分子生物学和计算机信息处理技术相结合的、以计算机为工具对生物信息进行储存、检索、分析的交叉学科,它的基本出发点是利用数据库技术和软件技术对大量积累的生物大分子序列数据和实验测定的序列进行结构比较和统计分析,推导揭示出序列同源下,生物大分子的分子结构、功能和进化关系。

这是分子生物学研究的一个新领域,同时也是生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,其研究的重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。

生物信息数据库种类繁多。

归纳起来主要分为四个大类:即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库、以上述三类数据库和文献资料为基础构建的二次文献数据库。

目前世界上几百家生物信息中心通过上千种联机服务提供有关生物信息的各类数据库,网络上的生物信息资源更是无法计算。

而且这些生物信息资源每时每刻都在迅速增长,并且每一种数据库、联机服务都有其独特的信息内容、数据格式和检索方式。

用户不得不花费大量的时间和精力去选择合适的信息资源。

就核酸序列和蛋白质序列而言,数据库内的数据信息太过于庞大,用户在对于信息的需求度方面也各有不同,有时仅仅是想要查询某一核酸或者蛋白质序列名称、编号等,但却需要十分详细地查询如人类、灵长类的高通量基因组序列,这时我们就需要选择合适的检索系统,科学的检索方法更方便高效准确地查询到我们所需要的数据。

ENTREZ和SRS是目前使用较为广泛的生物信息检索系统,本课题通过研究基于ENTREZ和SRS的生物信息数据检索方法和效果,从而帮助用户在在各类生物信息数据库数据庞大的背景下高效准确地检索出所需要的信息。

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