铁皮石斛YABBY基因家族的全基因组鉴定和分析文献综述

 2023-03-27 10:28:31

YABBY基因家族

摘要:YABBY基因家族是种子植物特有的转录因子,含有YABBY结构域和C2C2锌指结构域。YABBY基因家族在多种发育过程的调控起着重要作用,如近远轴极性的建立、叶片发育、胚珠及花器官形成、果实发育、种子发育、植物激素合成以及胁迫响应等。YABBY基因家族在多种发育过程的调控中起的重要作用,已经在很多植物中得到了验证,但是尚未在铁皮石斛中进行过研究。为了探究铁皮石斛YABBY基因家族的成员和作用,本文综述前人在YABBY转录因子方面的最新研究成果,为研究YABBY转录因子在铁皮石斛中的作用提供理论依据。

关键词:铁皮石斛;YABBY转录因子;全基因组鉴定;生物信息学分析

YABBY Gene Family

Abstract:YABBY gene family is a transcription factor specific to seed plants, containing YABBY domain and C2C2 zinc finger domain. The YABBY gene family plays an important role in the regulation of various developmental processes, such as establishment of near-far axis polarity, leaf development, ovule and floral organ formation, fruit development, seed development, plant hormone synthesis and stress response. The important role of YABBY gene family in the regulation of various developmental processes has been verified in many plants, but it has not been studied in Dendrobium officinale. In order to explore the members and functions of YABBY gene family in Dendrobium officinale, this paper reviews the latest research results of YABBY transcription factors, and provides a theoretical basis for studying the role of YABBY transcription factors in Dendrobium officinale.

Key words:Dendrobium officinale;YABBY transcription factor;genome-wide identification ; bioinformatics analysis

YABBY基因家族是种子植物特有的转录因子,在多种发育过程的调控起着重要作用,如叶片的生长、胚珠及花器官形成、果实发育、种子发育和植物次生代谢物质的代谢植物激素合成以及胁迫响应等,这些已经在很多植物中得到了验证,本文综述前人在YABBY转录因子方面的最新研究成果,为研究YABBY转录因子在铁皮石斛中的作用提供理论依据。

YABBY基因家族成员的特征是两个保守结构域,一个C2C2锌指状结构域朝向氨基末端,另一个螺旋-环-螺旋,我们称之为YABBY结构域,与HMG盒前两个螺旋朝向蛋白羧基端具有序列相似性。除了保守的YABBY和锌指结构域外,YAB1、YAB2、YAB3和YAB5在YABBY结构域的羧基侧也显示出一定的序列相似性。YABBY和锌指之间的区域在家庭成员中是可变的。这些结构域的存在表明这些蛋白作为转录因子发挥作用。数据库搜索表明,该家族可能是植物特有的,因为具有类似锌指和YABBY结构域的基因在线虫和酿酒酵母中都不存在。

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